Nước mắm Phú Quốc có lịch sử phát triển trên 200 năm, được chế biến từ nguồn nguyên liệu tự nhiên trên đảo. Lúc đầu ngư dân khai thác nguồn nguyên liệu bằng phương tiện thô sơ, thủ công và tiêu thụ chủ yếu ở địa phương. Dần dần, nước mắm Phú quốc được bán rộng rãi trong nước và các nước láng giềng như: Campuchia, Thái Lan … đến thập niên 1950 nước mắm Phú Quốc bắt đầu nổi tiếng và được xuất khẩu sang một số nước Châu Âu. Trải qua quá trình tìm tòi, học hòi, cải tiến từ kỹ thuật thô sơ đến hiện đại, tích lũy phương pháp truyền thống để nâng cao chất lượng…
Giai đọan đầu hình thành nghề nước mắm Phú Quốc được tính từ năm 1900 đến 1945. Vùng biển Phú Quốc lúc này có rất nhiều cá cơm, loại cá thân nhỏ, thơm ngon và có nhiều chất đạm. Ngư dân đánh bắt về với số lượng khá nhiều nên không thể ăn tươi ngay một lúc được. Họ nghĩ ra cách đem ướp với muối để sử dụng lâu dài. Vì để lâu nên cá chín tạo ra lọai nước màu đỏ và có độ trong, vị mặn đậm đà, người dân rất thích dùng để ăn sống hay nấu nướng. Từ đó, nghề nước mắm ra đời.