Sau những nỗ lực di chuyển nhằm cứu hòn đảo khỏi những kẻ xâm lược ở phần 4, nhóm người quay về đất liền trở lại đảo và bất ngờ bị dịch chuyển thời gian: một nửa ở lại năm 2007, nửa kia bị trở lại những năm 1973.
Nhóm người trở về năm 1973 để bảo vệ mình phải hòa nhập với cuộc sống ở đây và tìm cách cứu hòn đảo khỏi 1 thảm họa diệt vong, còn những người ở hiện tại tiếp tục tìm hiểu các bí mật trên đảo. Cuối phần 5 , một lời cảnh báo được đưa ra " Bọn họ đang đến" - "They coming"...