300 năm sau khi cuộc nội chiến trên Cybertron - The Great War kết thúc với sự thắng lợi của quân Autobots trước Decepticons. Theo hiệp định hòa bình Pax Cybertronia, Decepticons chịu nhiều bất lợi sau cuộc chiến.
Hiệp định được duy trì cho đến khi một Predacon - hậu duệ của Decepticons có tên Megatron và đồng bọn của hắn đánh cắp chiếc đĩa vàng - The Golden Disk và trốn thoát khỏi Cybertron trên con tàu Darksyle. Với chiếc đĩa vàng, Megatron dự tính đi tìm nguồn Energon có thể giúp hắn gây ra cuộc chiến lớn lần thứ hai chống lại Maximals là các hậu duệ của Autobots và thống trị vũ trụ.
Để ngăn cản mưu đồ bá chủ của Megatron, thuyền trưởng tàu Axalon, Optimus Primal cùng đồng đội của anh truy đuổi Megatron. Trong cuộc giao tranh trên không phận của một hành tinh lạ. Cả tàu Axalon và Darksyle bị hư hại và mắc kẹt tại hành tinh lạ đó. Tại đây, các chiến binh của phe Predacon và Maximal bắt đầu cuộc chiến siêu thú xoay quanh nguồn năng lượng Energon và tìm đường trở về Cybertron...