Không giống như 2 phần trước, phần 3 của phim được chia thành 2 phần do sự gián đoạn. Mở đầu phim là bối cảnh 4 tháng sau khi đội quân Cylon đã chiếm được New Caprica nhưng cuộc tranh giành giữa loài người và Cylon vẫn tiếp tục. Trong khi đó, Adama và Apollo tranh cãi về kế hoạch giải cứu người dân thuộc địa.