Ngoài nhưng tính năng của phiên bản chuẩn, phiên bản nâng cao bổ sùng thêm các phân hệ Tài sản cố định, Công cụ dụng cụ,... đáp ứng đầy đủ nghiệp vụ kế toán, cho phép bạn tạo ra nhiều hệ thống sổ sách kế toán khác nhau với một vài thao tác đơn giản.
Kế toán tiền mặt, tiền gửi ngân hàng :
Không những theo dõi số tiền gửi vào, rút ra và số dư tiền gửi của từng ngân hàng mà còn có thể chi tiết đến từng trương mục ngân hàng, từng loại tiền tệ.
Lưu được nhiều loại tiền tệ và tỷ giá thời điểm trên mỗi chứng từ thu chi ngoại tệ và in được các báo cáo có tiền ngoại tệ và tiền hạch toán song song. 
Kế toán tiền vay:
Có thể theo dõi từng lần đi vay bằng danh mục Hợp đồng vay vốn, qua đó biết được là vay của ai, bao nhiêu tiền, thời hạn bao lâu, mỗi tháng trả lãi bao nhiêu %, đã trả được bao nhiêu, còn lại bao nhiêu…
Theo dõi các khoản vay trên báo cáo sổ chi tiết tiền vay theo từng đối tượng, từng hợp đồng vay.
Kế toán mua hàng và nợ phải trả:
Theo dõi các hợp đồng mua bằng danh mục Hợp đồng kinh doanh.
Cho phép mua hàng trả tiền ngay trên 1 phiếu mua hàng và in được cả phiếu chi lẫn phiếu nhập kho trên đó.
Phân biệt mua hàng nội địa, mua hàng nhập khẩu, mua dịch vụ.
Tự động tạo ra phiếu trả hàng cho NCC từ phiếu nhập mua trước đó.
Theo dõi công nợ phải trả theo nhiều loại tiền tệ.
Tính tuổi nợ phải trả và theo dõi tình hình phải trả chi tiết cho từng hóa đơn mua
Kế toán bán hàng và nợ phải thu:
Theo dõi các hợp đồng bán bằng danh mục Hợp đồng kinh doanh.
Cho phép bán hàng thu tiền ngay trên 1 phiếu bán hàng và in cả phiếu thu lẫn phiếu xuất kho. Phiếu bán hàng thu tiền ngay này có thể được chuyển qua từ phân hệ bán lẻ.
Phân biệt bán hàng hóa nội địa, bán hàng xuất khẩu và bán dịch vụ.
Tự động tạo phiếu nhập kho hàng bán bị trả lại từ phiếu xuất bán trước đó.
Theo dõi công nợ phải thu theo nhiều loại tiền tệ.
Tính tuổi nợ phải thu và theo dõi tình hình phải thu chi tiết cho từng hóa đơn bán.
Kế toán hàng tồn kho:
Theo dõi nhập xuất nguyên vật liệu, hàng hóa, thành phẩm...
Theo dõi tồn kho trên từng tài khoản, hàng hóa, kho hàng, số lô hàng, số seri …
Tính và hiện ra giá vốn tức thời khi xuất kho và tính lại 1 lần nữa vào cuối kỳ kế toán.
Quy đổi đơn vị tính linh hoạt.
Kế toán tài sản cố định:
Theo dõi quá trình khấu hao, quá trình tăng giảm của tài sản cố định.
Tự động trích và phân bổ khấu hao theo phương pháp cũng như đối tượng sử dụng do người dùng thiết lập.
Kế toán công cụ dụng cụ:
Theo dõi quá trình phân bổ giá trị công cụ dụng cụ.
Tự động trích và phân bổ theo phương pháp cũng như đối tượng sử dụng do người dùng thiết lập.
Kế toán tổng hợp
Cho phép nhập và in tất cả các bút toán điều chỉnh và tổng hợp.
Cho phép khai báo và tự động kết chuyển chi phí, doanh thu cuối kỳ
In các báo cáo tài chính và quản trị.
Cấu hình tài khoản dễ dàng, thuận tiện với nhiều đối tượng theo dõi, kiểu số dư và đối tượng số dư.
Cấu hình nghiệp vụ đa dạng có thể đáp ứng cho nhiều loại hình doanh nghiệp khác nhau kể cả các doanh nghiệp có mô hình nghiệp vụ phức tạp.
Phân quyền chi tiết đến từng thao tác nghiệp vụ : Xem, Thêm, Sửa, Xoá, Khóa, Mở khóa chứng từ.
Phân quyền chi tiết đến từng tài khoản: Xem, nghiệp vụ liên phát sinh liên quan đến tài khoản.
Phân quyền chi tiết đến từng báo cáo,mẫu phiếu: Xem, sửa mẫu báo cáo
Có thể phân quyền người dùng được Xem hay Sửa đơn giá nhằm bảo mật thông tin tốt hơn.
Người dùng chỉ nhìn thấy những nghiệp vụ, báo cáo trên chương trình mà mình được phân quyền nhằm đơn giản hoá giao diện giúp tập trung vào công việc chính.
Danh mục:
Quản lý toàn bộ các đối tượng phát sinh liên quan đến hoạt động SXKD của DN bằng các danh mục: Hàng hóa, khách hàng, nhà cung cấp, ngân hàng, tài khoản ngân hàng, nhân viên, phòng ban, đơn vị trực thuộc, hợp đồng kinh doanh, hợp đồng vay vốn, công trình đầu tư và xây dựng cơ bản, dự án, Đơn vị đầu tư, Tài sản cố định, Công cụ dụng cụ, Chi phí trả trước, Cổ phiếu, Trái phiếu... Đặc biệt, bạn có thể tự thêm thông tin cần theo dõi và quản lý trên bất kỳ danh mục nào.
Danh mục hệ thống tài khoản theo hình cây thư mục có thể thiết lập để theo dõi số dư của tất cả các danh mục có trong SaigonIT-Accounting.
Một tài khoản có thể theo dõi số dư theo nhiều cách khác nhau: số dư bên Nợ, bên Có, bên lớn, dư hai bên hoặc không theo dõi số dư.
Số dư ban đầu :
Số dư tiền tệ, công nợ, tồn kho,…Nhập đến đâu chương trình tự kiểm tra đến đó. Giúp bạn kiểm soát số liệu thật chặt chẽ.
Thuế :
Tự động tính ra số tiền thuế GTGT, tiêu thụ đặc biệt, xuất nhập khẩu tùy theo từng mặt hàng và tự động điền các tài khoản thuế GTGT, thuế tiêu thụ đặc biệt, thuế xuất nhập khẩu khi phát sinh số tiền thuế.
Cho phép tạo nhiều hóa đơn trên một chứng từ mua hàng (bán hàng) hoặc ngược lại: một hóa đơn cho nhiều chứng từ mua (bán) hàng.
Quản lý hóa đơn mua vào, bán ra một cách chặt chẽ theo tình trạng: chưa xuất, đã xuất, xóa bỏ, mất.
Chỉ cần khai báo đường dẫn phần mềm kê khai thuế. Tất cả bảng kê hóa đơn mua vào, bán ra từ SaigonIT-Accounting sang chương trình HTKK của Cục thuế chỉ bằng một cái nhấn nút duy nhất mà không cần phải export từ chương trình ra Excel rồi Import từ tập tin Excel vào phần mềm kê khai thuế.
Xử lý:
Kiểm tra tính hợp lệ của chứng từ khi ghi sổ. Giúp tránh những sai sót không đáng có trong khi nhập liệu.
Có thể tạo ra các chứng từ tự động kèm theo chứng từ gốc như là: xuất kho hàng bán, thu tiền bán hàng, chi trả NCC, giảm giá hàng bán, hàng bán bị trả lại... Đơn giản bạn chỉ cần nhập liệu một lần rồi tự động chương trình sẽ phát sinh, phát sinh…Giảm thiểu việc nhập liệu trong các khâu trung gian. Giúp bạn tiết kiệm nhiều thời gian quý báu để làm việc khác.
Khả năng tạo bút toán kết chuyển hết sức mềm dẻo. Bạn thật ngạc nhiên có được kết quả lãi lỗ theo từng hợp đồng, dự án chỉ sau vài dòng khai báo.
Tự động tính giá vốn ngay khi xuất hàng nên cuối tháng tính lại rất nhanh. Các bút toán cuối kỳ như tính giá vốn hàng bán, xử lý chênh lệch tỷ giá, kết chuyển lãi lỗ, chuyển số dư sang kỳ sau được thực hiện tự động.
Một chứng từ có thể tách thành nhiều chứng từ, cũng như gộp nhiều chứng từ thành một chứng từ duy nhất một cách nhanh chóng
Theo dõi công nợ, tồn kho theo chi tiết nhất mà bạn muốn. Thông tin cập nhật tức thời tại mọi thời điểm. Bạn hoàn toàn kiểm soát được kế hoạch thu chi, nhập xuất để sắp xếp kế hoạch phù hợp.
Báo cáo:
Xem ngay báo cáo với số liệu chính xác sau khi ghi sổ chứng từ.
Cho phép kéo thả các cột dữ liệu trên lưới số liệu để tạo ra các báo cáo phân tích khác nhau.
Xuất dữ liệu của báo cáo ra Word, Excel, PDF, HTML, TXT , Image File …
Hệ thống báo cáo đa dạng, đáp ứng nhu cầu theo dõi chi tiết, có thể sửa lại mẫu và lưu thành nhiều phiên bản khác nhau.
Cho phép cấu hình tính toán các chỉ tiêu trong báo cáo tài chính, đáp ứng những thay đổi liên tục của chế độ kế toán.
Tích hợp:
Phần mềm SaigonIT-Accounting hoàn toàn tích hợp với các phần mềm khác trong hệ thống. Đảm bảo dữ liệu luôn thông suốt với phần mềm bán hàng, kho hàng, cung ứng, giao nhận. Giải tỏa sự lo lắng khi bạn sử dụng nhiều phần mềm trong hệ thống.
Với mô hình tổng công ty. Bạn có thể tích hợp số liệu báo cáo tài chính hoặc toàn bộ số liệu từ công ty con lên công ty mẹ.
Hệ thống bền vững:
Xây dựng trên công nghệ .NET tiên tiến của Microsoft. Nên bạn hoàn toàn yên tâm SaigonIT-Accounting luôn cùng đồng hành vững bước đến tương lai.
Cơ sở dữ liệu MS SQL Server cho phép tăng khả năng xử lý dữ liệu và được sao lưu tự động hàng ngày nên sẽ rất an toàn.
Phần mềm có thể chạy trên tất cả các hệ điều hành của Microsoft như Windows XP, Vista, 7, Server 2003, Server 2008...