Atlantis: End of a World, Birth of a Legend xoay quanh một câu chuyện về thảm họa thiên nhiên lớn nhất từng xảy ra trong lịch sử cổ đại. Năm 1620 trước Công nguyên, một miệng núi lửa sau 19 ngàn năm âm ỉ bỗng nhiên phun trào, bao trùm cả vùng biển Aegean rộng lớn. Đợt phun trào này cũng đã phá hủy quần đảo Thera và gây ra trận sóng thần tàn khốc tấn công đảo Crete. Nhiều nhà nghiên cứu cho rằng câu chuyện lịch sử này chính là nguồn cảm hứng cho hàng loạt truyền thuyết về Atlantis.