Mặc dù đóng vai trò là “trung tâm động lực” của ĐBSCL nhưng cơ sở hạ tầng của Cần thơ nói riêng cũng như của ĐBSCL nói chung còn rất nghèo nàn, phát triển chưa tương xứng với tốc độ phát triển các hoạt động kinh doanh thương mại của doanh nghiệp. Đây là một trở ngại rất lớn, không chỉ cho doanh nghiệp địa phương mà còn cả cho các nhà đầu tư từ các nơi khác đến. Doanh nghiệp địa phương hiện đang phải “gánh” những chi phí lớn (về vận tải) khiến giá thành cao và khó cạnh tranh. Các dự án về phát triển cơ sở hạ tầng của TW (như đoạn QL1 chạy qua thành phố Cần Thơ đến giao lộ đường dẫn cầu Cần Thơ tại phường Ba Láng, quận Cái Răng) và hàng chục dự án của địa phương được tiến hành không đồng bộ khiến cho việc đưa vào sử dụng sẽ bị chậm, kéo dài thời gian, phát sinh chi phí và kém hiệu quả.
