1. Tiếp nhận hồ sơ tính thuế:
Toàn bộ hồ sơ của các lô hàng xuất khẩu, nhập khẩu, do bộ phận giám sát quản lý khi đã kiểm tra hàng hoá xong được chuyển về phòng kiểm tra thu thuế (bộ phận tính thuế) để tính thuế.
- Khi tiếp nhận hồ sơ, chứng từ do phòng giám sát quản lý chuyển sang phải kiểm tra lại toàn bộ hồ sơ hiện có.
- Nếu hồ sơ (chứng từ) đảm bảo tính hợp pháp, hợp lệ thì tiếp nhận ghi sổ theo dõi và chuyển cho bộ phận tính thuế để tính thuế.
2. Tính thuế:
- Cán bộ tính thuế căn cứ vào các yếu tố tính thuế kiểm tra lại.
Các yếu tố đã ghi trên hồ sơ gốc xác định:
- Xác định mã số tính thuế để khẳng định thuế suất từng mặt hàng. - Số lượng từng mặt hàng chịu thuế, chịu phụ thu... (theo kết quả kiểm hoá).
- Xác định giá tính thuế cho từng mặt hàng theo đúng quy định. Nếu trong bảng giá tối thiểu chưa có thì phải xây dựng giá tính thuế trình cấp thẩm quyền quyết định.
- Tính ra số thuế, số phụ thu, lệ phí... phải nộp.
- Viết thông báo thuế, phụ thu...
3. Duyệt, ký và xử lý những vướng mắc về giá, về thuế suất, giải quyết những khiếu nại tại chỗ của chủ hàng.
- Toàn bộ hồ sơ đã tính thuế xong chuyển cho lãnh đạo (phòng, đội) kiểm tra duyệt thuế, ký thông báo thuế.
- Những vướng mắc về giá, về thuế suất lãnh đạo phòng, đội phải nghiên cứu giải quyết hoặc trình lãnh đạo Cục giải quyết.
- Những hồ sơ đã ký thông báo thuế chính thức được đóng dấu "đã làm thủ tục hải quan" và chuyển trả cho chủ hàng 1 tờ khai hải quan, 1 thông báo thuế và các chứng từ liên quan đến lô hàng để giải phóng hàng.
- Những hồ sơ (chứng từ) còn lại được chuyển cho bộ phận hạch toán kế toán.
4. Hạch toán kế toán.
a) Bộ phận hạch toán kế toán chi tiết:
- Tiếp nhận hồ sơ "đã làm thủ tục hải quan".
- Căn cứ thông báo thuế, biên lai thu tiền, ghi sổ kế toán chi tiết tài khoản 65.
- Theo dõi nợ thuế và đôn đốc chủ hàng nộp thuế.
- Viết biên lai khi chủ hàng đến nộp tiền thuế, tiền phụ thu, tiền phạt...
- Viết phiếu thu để thủ quỹ thu tiền.
- Viết phiếu chi, giấy nộp tiền, để thủ quỹ nộp tiền thuế, phụ thu, lệ phí... vào ngân sách.
- Tổng hợp số liệu cuối mỗi ngày của phần mình.
Phụ trách chuyển cho kế toán tổng hợp ghi sổ tổng hợp
- Đóng dấu đã hoàn thành thủ tục hải quan cho những lô hàng đã nộp đủ thuế.
b) Bộ phận hạch toán tổng hợp
- Ghi sổ kế toán tổng hợp hàng ngày.
- Đôn đốc hạch toán kế toán chi tiết, cung cấp số liệu tài liệu cần thiết liên quan đến kế toán tổng hợp.
- Lập các báo cáo kế toán theo chế độ quy định.
5. Phúc tập hồ sơ (chứng từ)
- Công tác phúc tập hồ sơ là công tác cuối cùng của quy trình nghiệp vụ hải quan. Vì vậy, bộ phận phúc tập hồ sơ có nhiệm vụ:
- Phân loại hồ sơ (chứng từ) loại hình XNK.
- Kiểm tra phát hiện những sai sót trong hồ sơ.
- Đóng dấu "đã phúc tập" vào những bộ hồ sơ đã qua kiểm tra.
- Sắp xếp, lưu trữ, bảo quản và quản lý hồ sơ theo đúng quy định.