Quân đoàn New South Wales
Năm 1792 hải quân hoàng gia Anh được thay thế bởi Quân Đoàn New South Wales, được tuyển mộ từ nước Anh. Được cấp đất, những thành viên trong quân Đoàn này đã trở thành những nông dân giỏi nhất của vùng thuộc địa, nhưng cũng là một nỗi đe dọa cho chính quyền của thống sứ tại đây vì sự thao túng kinh tế của họ. Với sự lanh lợi trong việc gia tăng thu nhập của họ, những thành viên của quân Đoàn đã kiểm soát giá rượu rum, một mặt hàng trao đổi chính của vùng đất thực dân này.
John Hunter, vị thống đốc kế tiếp Phillip, đến đây năm 1795, đã cố gắng một cách vô ích trong việc kiểm soát việc mua bán rượu rum. Vị thống đốc tiếp theo nữa là Philip G.King phục vụ từ năm 1800 đến năm 1806, cũng không thành công trong việc này. Cả hai vị thống đốc này đều phải tiếp nhận thêm những người mới đến nhập cư, và năm 1804 King đã phải sử dụng quân Đoàn này để dẹp cuộc nổi loạn của những tù nhân người Ái Nhĩ Lan.
Năm 1806, William Bligh đến thay thế Kinh. Bligh đã đe doạ quân Đoàn là sẽ tước đi sự độc quyền của họ. Kết quả là Cuộc Nổi loạn Rượu Rum đã nổ ra vào ngày 26 tháng Giêng năm 1808, trong đó những sĩ quan của quân Đoàn đã truất phế Bligh. Trở về Luân Đôn, Bligh đã thành công trong việc bảo vệ các chính sách của mình, nhưng ông không được bổ nhiệm để cai trị ở Úc nữa. Tuy nhiên Cuộc Nổi loạn Rượu Rum chỉ thắng thế trong một thời gian ngắn, sau đó quân Đoàn đã bị chính quyền đế quốc giải tán. Trong khi đó, một trong người lãnh đạo cuộc nổi loạn này, John Macarthur, đã tìm ra giải pháp cho tình trạng thiếu mặt hàng xuất khẩu của thuộc địa: năm 1802 ông ta đã cho các nhà sản xuất Anh Quốc xem những mẫu len của Úc. Tuy nhiên, mãi cho đến sau năm 1810, với việc nuôi giống cừu merino, việc chăn thả cừu đã dần dần phát triển thành một hoạt động kinh tế chính ở đây.