Cây biến đổi di truyền có thể ảnh hưởng đến những cây bên cạnh không?
Dòng gen giữa những cây được biến đổi di truyền và những cây không bị biến đổi, qua trung gian là hạt phấn, là rủi ro môi trường lớn nhất. Trên thực tế, hạt phấn chứa nhân tế bào thực vật và toàn bộ các gen của nó, kể cả gen có lợi. Để một hiện tượng truyền gen như vậy xảy ra, trước hết phải có cùng loại cây không bị biến đổi hoặc một cây dại có họ hàng ở gần cây được biến đổi di truyền và dễ lai với nó. Ví dụ, cải củ dại lai với cải dầu. Nếu trường hợp lai này xảy ra, khi ấy phải có sự truyền gen “mới”, cây lai tạo ra phải sống được và hữu thụ, hạt sinh ra phải nảy mầm, mọc thành cây, và những cây này phải lai với loài hoang dại một lần nữa, với sự truyền gen lần nữa. Nếu gen truyền này tạo cho cây một ưu thế (ví dụ kháng được thuốc diệt cỏ và tồn tại trong một số môi trường canh tác), nó có nguy cơ được duy trì qua các thế hệ. Nguy cơ này sẽ ít hơn với một gen được truyền không tạo ra thêm ưu thế. Do đó, phải đánh giá vấn đề trong từng trường hợp. Kỹ thuật truyền gen vào lục lạp đã nói ở trên giúp hạn chế sự "nhiễm gen'' qua hạt phấn, vì hạt phấn thường không có lục lạp.
